Na Polónia ocupada, a maioria dos judeus foi forçada a viver em guetos. Noutras partes da Europa ocupada, os judeus foram encaminhados para campos de trânsito, antes da sua deportação para a Polónia ocupada.

Theresienstadt (muitas vezes referida como Terezin) foi criada como campo para judeus da Boêmia e da Morávia. Serviu então como campo de trânsito para judeus europeus a caminho de Auschwitz. As condições eram incrivelmente duras. Mais de 50 mil judeus estavam reunidos num espaço anteriormente habitado por 7 mil tchecos. Terezin foi divulgada pelos nazistas como um local de alta cultura – muitos artistas, músicos e outros profissionais das artes foram detidos lá antes da deportação. Mas o campo serviu como um exercício de propaganda muito mais sinistro. Sob pressão da comunidade internacional, os nazistas permitiram que a Cruz Vermelha Internacional visitasse o “campo de trânsito” em julho de 1944. Um período intensivo de deportações ocorreu antes da visita, e o campo foi “embelezado” – jardins foram plantados, concertos foram realizadas e um filme de propaganda foi criado saudando o campo como um “modelo de assentamento judaico”. A farsa funcionou e a Cruz Vermelha Internacional ficou satisfeita com o tratamento dispensado aos prisioneiros. Após a visita, as deportações foram retomadas.
Os acordos para o trânsito de judeus e o nível de cooperação e colaboração das populações locais não-judias variaram dramaticamente de país para país nas áreas ocupadas pelos alemães:
França
O Governo de Vichy ajudou a organizar a deportação de judeus – mais de 70.000 pessoas foram deportadas através do campo transitório de Drancy, nos arredores de Paris. A maioria dos judeus deportados foi assassinada no leste, porém mais de três quartos dos judeus franceses sobreviveram à ocupação alemã.
Holanda
Mais de 100.000 judeus foram transportados à força – a maioria foi processada através do campo de trânsito de Westerbork. Anne Frank, cujo diário aumentou a conscientização sobre os horrores do Holocausto, foi detida em Westerbork depois que o esconderijo de sua família foi entregue à Gestapo. No entanto, 30.000 judeus holandeses sobreviveram, principalmente por terem sido escondidos com sucesso por cidadãos holandeses não-judeus. Em 1941, partes da população realizaram greves em protesto contra a deportação do povo judeu – mas esta resistência não pôde ser sustentada e a maioria de uma das populações judaicas mais bem estabelecidas da Europa foi exterminada.
Bélgica
A população judaica belga consistia principalmente de imigrantes recentes da Alemanha nazista. Muitos deles envolveram-se rapidamente em actividades de resistência e menos de metade foram deportados para a morte. Mechelen foi o principal campo através do qual os judeus foram deportados – situado num importante entroncamento ferroviário entre Bruxelas e Antuérpia.
Itália
Fossoli di Carpi foi o principal campo de trânsito e 6.800 dos 45.200 judeus da Itália foram deportados.
Grécia
Após a ocupação alemã, os judeus que viviam em Salónica (Salonica) – o centro da vida judaica sefardita na Europa, com mais de 50.000 cidadãos judeus – foram sistematicamente transferidos para um gueto perto da estação ferroviária, de onde foram deportados.
Eslováquia
O governo colaboracionista do tempo de guerra participou avidamente na deportação da sua população judaica, pagando mesmo ao regime alemão uma taxa para remover os judeus eslovacos. 80% dos judeus na Eslováquia foram assassinados. Sered serviu como campo de trânsito, enviando milhares de pessoas para campos de extermínio na Polônia ocupada.
Hungria
Apesar da sua aliança com a Alemanha nazi e das leis anti-semitas, o governo da Hungria resistiu a cooperar com os planos dos nazis para a deportação de mais de 500.000 judeus húngaros. As deportações só começaram quando a Alemanha invadiu, em Março de 1944. A liderança alemã garantiu que os judeus da Hungria fossem presos e transportados para campos na Polónia ocupada com uma eficiência implacável – quase 450.000 foram forçados a embarcar em comboios, principalmente para Auschwitz.


